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福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所共承擔(dān)國(guó)家、省部級(jí)科研任務(wù)50多項(xiàng)，其中***項(xiàng)目6個(gè)、省級(jí)項(xiàng)目41個(gè)、橫向聯(lián)合研究項(xiàng)目15個(gè)，經(jīng)費(fèi)共達(dá)3000多萬(wàn)元。先后獲國(guó)家、部省級(jí)以上科技成果近60項(xiàng)，填補(bǔ)國(guó)內(nèi)外多項(xiàng)空白；發(fā)表論文476篇，出版著作11部。

在獲獎(jiǎng)成果中，“雛番鴨細(xì)小病毒病病原發(fā)現(xiàn)、診斷和防治”2002年榮獲國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)；“禽霍亂莢膜抗原疫苗的研究”于1990年榮獲農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)；“福建省牛流行性腹瀉的病原診斷研究”、“雛番鴨細(xì)小病毒病活疫苗和快速診斷試劑研究”榮獲1983、2001年福建省科技成果一等獎(jiǎng)；“肉雞配合飼料的研究”、“雞新城疫病毒單克隆抗體的研究”、“莆田黑鴨高產(chǎn)系選育”、“雛番鴨細(xì)小病毒病病原發(fā)現(xiàn)、鑒定和診斷研究”、“小型白羽半番鴨母本的選育研究”、“鴨出血癥病原學(xué)及診斷技術(shù)研究”，榮獲1986、1987、1989、1993、2005、2006年福建省科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)；“雛番鴨細(xì)小病毒病活疫苗”、“雛番鴨細(xì)小病毒病乳膠凝集試驗(yàn)和凝集抑制試劑”榮獲2000年國(guó)家一類獸藥證書，2003年國(guó)家新產(chǎn)品證書。2006年“福建省康牧生物技術(shù)開發(fā)中心”通過國(guó)家農(nóng)業(yè)部驗(yàn)收。“福建省動(dòng)物生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室”2006年通過中國(guó)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家認(rèn)可委員會(huì)認(rèn)可，2007年通過農(nóng)業(yè)部資格審查并核發(fā)《高致病性動(dòng)物病原微生物實(shí)驗(yàn)室資格證書》。“畜禽疫病防治技術(shù)工程研究中心”、“福建省畜禽分子遺傳育種工程”通過省級(jí)驗(yàn)收。